مدیریت فن آوری اطلاعات دانشگاه علوم پزشکی کاشان در مهرماه سال 1385 به منظور حفظ، نگهداری، ارتقاء و توسعه فن آوری اطلاعات دانشگاه، بعنوان یکی از مدیریت های معاونت پژوهشی دانشگاه شروع به فعالیت نمود.
واحد آمار دانشگاه علوم پزشکی کاشان از ابتدای اردیبهشت ماه 1388 با واحد فن آوری اطلاعات دانشگاه ادغام و تحت عنوان مرکز آمار و فن آوری اطلاعات دانشگاه فعالیت خود را ادامه داد. در حال حاضر مرکز مدیریت آمار و فن آوری اطلاعات دانشگاه زیر نظر مستقیم ریاست دانشگاه فعالیت می نماید.